A primeira igreja matriz de Quissamã foi inaugurada em 1815. Na primeira metade do século seguinte, a comunidade decidiu pela construção de um novo prédio e, depois de três anos de obras, foi inaugurada, em 1924, a atual Igreja Matriz Nossa Senhora do Desterro. Em estilo eclético europeu, com elementos dos templos religiosos alemãs do início do século XX, a igreja é caracterizada pela planta de nave única e a torre do sino, que se ergue ao centro da fachada. No interior, há altares e imagens sacras da antiga matriz. Restaurada em 2008, a Igreja Matriz Nossa Senhora do Desterro tem um conjunto arquitetônico do qual fazem parte o convento dos padres redentoristas e a gruta artificial dedicada a Nossa Senhora de Lourdes.
Quissamã possui um dos maiores e mais importantes patrimônios históricos e culturais do Estado do Rio de Janeiro, especificamente relacionado com o desenvolvimento e apogeu da produção do açúcar no norte fluminense